Publication List
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Single-cell Synaptome Mapping of Endogenous Protein Subpopulations in Mammalian Brain Motokazu Uchigashima, Risa Iguchi, Kazuma Fujii, Kaito Shiku, Pratik Kumar, Xinyi Liu, Mari Isogai, Chiaki Hoshino, Manabu Abe, Motohiro Nozumi, Yosuke Okamura, Michihiro Igarashi, Kenji Sakimura, Ryoma Bise, Luke D Lavis and Takayasu Mikuni Nature Communications | Paper |
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Learning from Majority Label: A Novel Problem in Multi-class Multiple-Instance Learning Shiku Kaito, Shinnosuke Matsuo, Daiki Suehiro and Ryoma Bise Pattern Recognition | Paper | Code |
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Hierarchical Co-Embedding of Font Shapes and Impression Tags Yugo Kubota, Kaito Shiku and Seiichi Uchida ICDAR 2026 | Paper |
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Leveraging Vision-Language Models as Weak Annotators in Active Learning Phuong Ngoc Nguyen, Kaito Shiku, Ryoma Bise, Seiichi Uchida and Shinnosuke Matsuo ICIP 2026 | Paper |
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Hypernetwork-Based Adaptive Aggregation for Multimodal Multiple-Instance Learning in Predicting Coronary Calcium Debulking Kaito Shiku, Ichika Seo, Tetsuya Matoba, Rissei Hino, Yasuhiro Nakano and Ryoma Bise ISBI 2026 | Paper | Code |
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Auxiliary Gene Learning: Spatial Gene Expression Estimation by Auxiliary Gene Selection Kaito Shiku, Kazuya Nishimura, Shinnosuke Matsuo, Yasuhiro Kojima, and Ryoma Bise AAAI 2026 | Paper | Code |
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Learning Relative Gene Expression Trends from Pathology Images in Spatial Transcriptomics Kazuya Nishimura, Haruka Hirose, Ryoma Bise, Kaito Shiku and Yasuhiro Kojima NeurIPS 2025 | Paper | Code |
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Domain Adaptation for Ulcerative Colitis Severity Estimation Using Patient-Level Diagnoses Takamasa Yamaguchi, Brian Kenji Iwana, Ryoma Bise, Shota Harada, Takumi Okuo, Kiyohito Tanaka and Shiku Kaito Workshop on MICCAI 2025 | Paper |
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Ordinal Multiple-instance Learning for Ulcerative Colitis Severity Estimation with Selective Aggregated Transformer Shiku Kaito, Kazuya Nishimura, Daiki Suehiro, Kiyohito Tanaka and Ryoma Bise WACV 2025 | Paper | Code |
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Counting Network for Learning from Majority Label Shiku Kaito, Shinnosuke Matsuo, Daiki Suehiro and Ryoma Bise ICASSP 2024 | Paper | Code |
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Cell Tracking in C. elegans with Cell Position Heatmap-Based Alignment and Pairwise Detection Shiku Kaito, Hiromitsu Shirai, Takeshi Ishihara and Ryoma Bise EMBC 2023 | Paper |
| Domestic conference (Japan) |
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Gleason Scoreを活用した弱教師あり学習による病理画像のセグメンテーション 菅田菜央，志久開人，松尾信之介，備瀬竜馬 パターン認識・メディア理解研究会（PRMU） |
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個別最適化された医療検査項目選択 筬島未輝夫，松尾信之介，志久開人，備瀬竜馬 第28回情報論的学習理論ワークショップ（IBIS2025） |
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空間トランスクリプトミクスにおけるバッチ効果と確率的ノイズ下での相対発現学習 西村和也，廣瀬遥香, 備瀬竜馬, 志久開人，小嶋泰弘 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2025） |
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Spatial Transcriptomics Estimation via Informative Gene Selection 志久開人，西村和也，松尾信之介，小嶋泰弘，備瀬竜馬 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2025） |
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誤りのある順序付きラベルに対する順序付きNegative Label Learning 竹崎隼平，志久開人，原田翔太，内田誠一 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2025） |
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冠動脈CT画像を用いた石灰化切削必要性推定のためのMultimodal Model 瀬尾惟周，志久開人，仲野泰啓，的場哲哉，備瀬竜馬 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2025） |
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Leveraging Patient-Level Diagnosis for Domain Adaptation in Ulcerative Colitis Severity Assessment Takamasa Yamaguchi, Brian Kenji Iwana, Ryoma Bise, Shota Harada, Takumi Okuo, Kiyohito Tanaka and Kaito Shiku 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2025） |
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医療検査項目の適応的選択法 筬島未輝夫，松尾信之介，志久開人，備瀬竜馬 2025年度電気・情報関係学会九州支部連合大会 |
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比率に基づく弱教師あり学習による病理組織認識 菅田菜央，志久開人，松尾信之介，備瀬竜馬 2025年度電気・情報関係学会九州支部連合大会 |
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潰瘍性大腸炎の重症度推定を目的とした選択的集約トランスフォーマーによる順序ありクラスのマルチインスタンス学習 志久開人 他4名 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2024） |
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多数派クラスラベルからの学習を目的とした数え上げネットワーク 志久開人，松尾信之介，末廣大貴，備瀬竜馬 画像の認識・理解シンポジウム（MIRU2024） |
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Multi Instance Learningとドメイン適応を用いた医療画像診断 山口天勝，志久開人，備瀬竜馬，田中聖人，Brian Kenji Iwana 2024年度第77回電気・情報関係学会九州支部連合大会 |
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冠動脈CTを用いた冠動脈疾患の手術支援 瀬尾惟周，志久開人，仲野泰啓，的場哲哉，備瀬竜馬 2024年度第77回電気・情報関係学会九州支部連合大会 |
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フォント利用に注目したデザインの品質判定 宮田萌，志久開人，内田誠一 2024年度第77回電気・情報関係学会九州支部連合大会 |
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最重症度ラベルを用いたマルチインスタンス学習 志久開人，西村和也，末廣大貴，備瀬竜馬 パターン認識・メディア理解研究会（PRMU） |
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多数派クラスラベルによるMultiple Instance Learning 志久開人，松尾信之介，末廣大貴，備瀬竜馬 情報論的学習理論と機械学習研究会（IBISML） |
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非剛体レジストレーションを用いた線虫の時系列3D神経細胞の追跡 志久開人，白井洸充，石原健，備瀬竜馬 医用画像研究会 (MI) |
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線虫の時系列3D神経細胞データに対する神経細胞追跡 志久開人，白井洸充，石原健，備瀬竜馬 2022年度電気・情報関係学会九州支部連合大会（第75回連合大会） |